В XVI в. Нидерландами правила католическая Испания. Движению реформ резко противостояли император Карл V и сменивший его Филипп II Испанский. Реформация в Нидерландах переросла в мощное политическое движение за независимость. Испанский герцог Альба (правитель Нидерландов в 1567-1573 гг.) был обвинён в гибели тысяч протестантов.

     В 1579 г. северные провинции (территория современного государства Нидерланды) объявили о своём отказе повиноваться испанскому королю и образовали федерацию под руководством Вильгельма Молчаливого (Вильгельм I Оранский). После долгой отчаянной борьбы они освободились и от Римской Церкви, и от испанской короны.

     Первый реформатский синод состоялся в Дорте в 1574 г. Через год был основан Лейденский университет. Новая Церковь приняла Гейдельбергский и Бельгийский символы веры и пошла по собственному пути церковной организации.